Karakteristikk genotype, reaksjonsstandard, bestemmelse

Han genotype Det er definert som settet med gener (med deres alleler) at de koder for en bestemt funksjon eller karakteristikk, som skiller seg fra andre ved en spesifikk funksjon eller sekvens. Noen forfattere definerer imidlertid det som den delen av genomet som gir opphav til fenotypen eller som allelisk konstitusjon av en organisme.

Selv om det er relatert, er ikke begrepene genotype og fenotype det samme. I denne forstand er fenotype definert som settet med synlige egenskaper til en organisme som er resultatet av uttrykket av dens gener, og til genotypen som sett med gener som resulterer i en bestemt fenotype.

Genotype og fenotype (Kilde: National Human Genome Research Institute [Public Domain] via Wikimedia Commons) Genotypen er bare en av faktorene som er involvert i etableringen av fenotypen, siden miljøets påvirkning og andre epigenetiske elementer som ikke er direkte relatert Til nukleotidsekvensen former også individers synlige egenskaper.

Dermed har to organismer den samme genotypen hvis de deler de samme gensettene, men det samme er ikke tilfelle for to organismer som tilsynelatende deler den samme fenotypen, siden lignende egenskaper kan være et produkt av forskjellige gener.

Det var den danske botanikeren Wilhelm Johansen, i 1909, som først introduserte i vitenskap begrepene genotype og fenotype, i en lærebok han med tittelen "Elementene i en teori om den eksakte arven ", som var produktet av en serie eksperimenter som utførte kryssing av rene linjer med bygg og erter.

Hans verk, sannsynligvis inspirert av de som ble laget noen år tidligere av Gregorio Mendel, betraktet som "Genetikk Far”, Tillot ham å avklare at genotypen til en organisme gir opphav til fenotypen gjennom forskjellige utviklingsprosesser og under påvirkning av miljøet.

[TOC]

Kjennetegn

Genotype er ikke akkurat det samme som genom. Her er skillet mellom begge konseptene:

- "Genom" refererer til alle genene som et individ har arvet fra foreldrene og hvordan de distribueres i kromosomene i kjernen.

- "Genotype" er betegnelsen som brukes til å referere for eksempel til settet med gener og deres varianter som gir opphav til et bestemt trekk, at et individ skiller seg ut i en populasjon eller en art.

Selv om det er utsatt for endringer på grunn av mutasjoner gjennom en organismeens vitale historie, er genotypen et relativt ufravikelig trekk ved individer, siden genene som er arvet i teorien, er de samme fra unnfangelse til død.

I en naturlig populasjon har allelene som utgjør en gitt genotype forskjellige frekvenser av utseende; Det vil si at noen vises i populasjoner mer enn andre, og dette gjelder mellom noen ting, med distribusjon, miljøforhold, tilstedeværelsen av andre arter, etc.

Begrepet "Genotype vill”Definerer den første alleliske varianten som finnes i naturen, men refererer ikke nødvendigvis til allelen som finnes oftere i en befolkning; og begrepet "genotype Mutant”Det brukes for øyeblikket til å definere de allelene som er forskjellige fra naturen.

For å skrive en genotype brukes vanligvis store bokstaver og små bokstaver, for å skille mellom allelene som en person besitter, enten det er homozygotisk eller heterozygot. Kapitalbrev brukes til å definere dominerende og små bokstaver for resessmers.

Genotype reaksjonsregel

Enkeltpersoner arver foreldrenes gener, men ikke de endelige produktene som er oppnådd fra deres uttrykk, fordi de er avhengige av mange eksterne faktorer og historien til deres utvikling.

I henhold til dette og bare henviser til miljøfaktorer, kan en genotype føre til mer enn en fenotype. Settet med mulige "resultater" av samspillet mellom en spesifikk genotype med forskjellige miljøer er det forskere har kalt "genotype reaksjonsregel".

Reaksjonsnormen til en genotype er da en slags "kvantifisering" eller registrering av de synlige egenskapene oppnådd fra interaksjonene mellom en genotype med visse miljøer. Det kan uttrykkes som grafikk eller tabeller som "forutsier" de mulige resultatene.

Det er selvfølgelig tydelig at reaksjonsstandarden bare refererer til en delvis genotype, en delvis fenotype og noen få miljøfaktorer, siden det i praksis er veldig vanskelig å forutsi absolutt alle interaksjoner og alle resultatene av disse.

Hvordan bestemmes genotype?

Bestem genotypen eller "genotipify" en organisme eller en populasjon av individer av samme art, gir mye verdifull informasjon om dens evolusjonsbiologi, dens befolkningsbiologi, dens taksonomi, dens økologi og dets genetiske mangfold.

I mikroorganismer som bakterier og gjær, siden de har høyere multiplikasjons- og mutasjonshastigheter enn de fleste flercellede organismer, gjør det å bestemme og kjenne genotypen som gjør det mulig av det samme.

For å bestemme genotypen er det nødvendig å få prøver av organismen du vil jobbe med, og de nødvendige typer prøver vil avhenge av hver organisme. Hos dyr, for eksempel, kan det tas prøver av forskjellige vev: hale, ører, avføring, hår eller blod.

Genotypen til en organisme kan bestemmes eksperimentelt takket være bruken av noen moderne teknikker, som vil avhenge av genomisk plassering av genene å studere, budsjett og tid, brukervennligheten og ytelsen som er ønskelig.

For tiden inkluderer teknikkene som brukes til genotipifisering av en organisme, veldig ofte bruk og analyse av molekylære markører for å oppdage polymorfismer i DNA og andre mer avanserte teknikker som innebærer genomsekvensering.

Flere ansattes markører

Blant de mest brukte markørene finner vi følgende:

- RFLPs (polymorfismer av restriksjonsfragmenter).

- AFLPs (amplifiserte fragmenter lengde polymorfismer).

- RapDs (tilfeldig amplifisert polymorf DNA).

- Mikrosatellitter eller SSRS (gjentatt enkel sekvens).

- ASAPS (primere assosiert med spesifikke alleler).

- SNPs (enkle nukleotidpolymorfismer).

Teknikker som bruker sekvensering og hybridisering

Og blant teknikkene som bruker spesifikk sekvensering og hybridisering av spesifikke sonder er:

- Sekvensering ved Sangers metode.

- Genotipifisering av høy ytelse.

- Øvelse "Goldengate”Fra Illumina.

- Sekvensering av genotipifisering (GBS).

- Taqman essay.

- Ny generasjons sekvensering.

- Mikroarre.

- Full genomsekvensering.

Referanser

1. Griffiths, a., Wessler, s., Lewontin, r., Gelbart, w., Suzuki, d., & Miller, J. (2005). En introduksjon til genetisk analyse (8. utg.). Freeman, w. H. & Selskap.
2. Klug, w., Cummings, m., & Spencer, C. (2006). Konsepter om genetikk (8. utg.). New Jersey: Pearson Education.
3. Kwok, s.-OG. (2001). Metoder for genotyping av enkeltnukleotidpolymorfismer. Annu. Rev. Genomikk HUM. Genet., 2(11), 235-258.
4. Mahner, m., & Kary, m. (1997). Hva er genomer, genotyper og fenotyper? Og hva med fenomer ? J. Teori. Biol., 186, 55-63.
5. Mueller, u. G., & Wolfenbarger, l. L. (1999). AFLP -genotyping og fingeravtrykk. Tre, 14(10), 389-394.
6. National Institute of Health. Hentet 14. mai 2019, fra www.NIH.Regjerer/
7. Patel, d. TIL., Zander, m., Dalton-Morgan, J., & Batley, J. (2015). Fremskritt innen plantegenotyping: Hvor fremtiden vil ta oss. I j. Batley (red.), Plantegenotyping: Metoder og protokoller (Vol. 1245, s. 1-11). New York: Springer Science + Business Media, New York.
8. Pierce, f. (2012). Genetikk: En konseptuell tilnærming. Freeman, w. H. & Selskap.
9. Schleif, r. (1993). Biologi genetikk og molekylær (2. utg.). Maryland: Johns Hopkins University Press.
10. Tümmler, f. (2014). Genotypemetoder. I en. Filloux & J. L. Ramos (red.), Metoder i molekylærbiologi (Vol. 1149, s. 33-47). New York.
11. Yang, w., Kang, x., Yang, q., Lin, og., & Fang, m. (2013). Gjennomgang av utviklingen av genotypemetoder for å vurdere dyremangfoldet. Journal of Animal Science and Biotechnology, 4(2), 2-6.